Die FunktionärInnen bilden den Vorstand eines Permatop-Vereins und führen daher alle in den Statuten verankerten Tätigkeiten durch. Darüber hinaus sind für die Verwaltungen der Mitgliedschaften, die Finanzen des Vereins, die Öffentlichkeitsarbeit und Kommunikation, die Organisation von Veranstaltungen und Projekten und die Planung von/für Vereinsgärten zuständig. Für die Vereinsgärten erarbeiten sie Gestaltungs- und Nutzungskonzepte. Außerdem erarbeiten die FunktionärInnen bei der Vereinsgründung den Grünraumplan für ihr Permatop.